Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms