Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syf2Q9D198 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms