Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lsm12Q9D0R8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lsm12Q9D0R8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms