Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab3bQ9CZT8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms