Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mis12Q9CY25 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms