Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms