Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms