Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Malsu1Q9CWV0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms