Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MINDY3Q9CV28 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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MINDY3Q9CV28 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MINDY3Q9CV28 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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