Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PclafQ9CQX4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PclafQ9CQX4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms