Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nicn1Q9CQM0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nicn1Q9CQM0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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