Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms