Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms