Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf17Q99MV7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf17Q99MV7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms