Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tdrd1Q99MV1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tdrd1Q99MV1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms