Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms