Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn1Q99JR1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfxn1Q99JR1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms