Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Foxp3Q99JB6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxp3Q99JB6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxp3Q99JB6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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