Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtpbp3Q923K4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Gtpbp3Q923K4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gtpbp3Q923K4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gtpbp3Q923K4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gtpbp3Q923K4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gtpbp3Q923K4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gtpbp3Q923K4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gtpbp3Q923K4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gtpbp3Q923K4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gtpbp3Q923K4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gtpbp3Q923K4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gtpbp3Q923K4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtpbp3Q923K4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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