Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim59Q922Y2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim59Q922Y2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms