Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atl3Q91YH5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atl3Q91YH5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms