Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y14

Pcdha6, Pcdha6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha6Q91Y14 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcdha6Q91Y14 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms