Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf183Q8QZS5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf183Q8QZS5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms