Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms