Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mkl1Q8K4J6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mkl1Q8K4J6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms