Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rassf9Q8K342 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rassf9Q8K342 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rassf9Q8K342 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rassf9Q8K342 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rassf9Q8K342 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rassf9Q8K342 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rassf9Q8K342 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms