Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stn1Q8K2X3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Stn1Q8K2X3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms