Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hacd3Q8K2C9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms