Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms