Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pkn3Q8K045 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn3Q8K045 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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