Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEF8

Rnf222, RING finger protein 222, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf222Q8CEF8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf222Q8CEF8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf222Q8CEF8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf222Q8CEF8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf222Q8CEF8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf222Q8CEF8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf222Q8CEF8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf222Q8CEF8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf222Q8CEF8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf222Q8CEF8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf222Q8CEF8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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