Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slfn5Q8CBA2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slfn5Q8CBA2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms