Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Col6a6Q8C6K9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Col6a6Q8C6K9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Col6a6Q8C6K9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Col6a6Q8C6K9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Col6a6Q8C6K9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Col6a6Q8C6K9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Col6a6Q8C6K9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Col6a6Q8C6K9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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