Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apol7cQ8C6E1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms