Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ubqln3Q8C5U9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln3Q8C5U9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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