Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C5C9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms