Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac7Q8C2B3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms