Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms