Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Trim35Q8C006 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Trim35Q8C006 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Trim35Q8C006 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Trim35Q8C006 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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