Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tnfsfm13Q8BXS2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tnfsfm13Q8BXS2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tnfsfm13Q8BXS2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tnfsfm13Q8BXS2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsfm13Q8BXS2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tnfsfm13Q8BXS2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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