Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Iffo1Q8BXL9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Iffo1Q8BXL9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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