Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lmod1Q8BVA4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms