Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Prpf18Q8BM39 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Prpf18Q8BM39 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Prpf18Q8BM39 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Prpf18Q8BM39 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Prpf18Q8BM39 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Prpf18Q8BM39 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Prpf18Q8BM39 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Prpf18Q8BM39 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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