Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubash3bQ8BGG7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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