Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg4bQ8BGE6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg4bQ8BGE6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg4bQ8BGE6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg4bQ8BGE6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atg4bQ8BGE6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Atg4bQ8BGE6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Atg4bQ8BGE6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atg4bQ8BGE6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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