Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc38a9Q8BGD6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc38a9Q8BGD6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms