Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NfascQ810U3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms