Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Smim19Q80ZU4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim19Q80ZU4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms