Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lrrc1Q80VQ1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lrrc1Q80VQ1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lrrc1Q80VQ1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc1Q80VQ1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc1Q80VQ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc1Q80VQ1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrrc1Q80VQ1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrrc1Q80VQ1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lrrc1Q80VQ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lrrc1Q80VQ1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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