Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Avl9Q80U56 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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